La Région de la Méditerranée orientale réfléchit au séquençage génomique et à son avenir dans le cadre de la surveillance intégrée des virus respiratoires – Monde

Avec ses multiples variantes telles que Delta et Omicron, la pandémie de COVID-19 a mis en évidence la nécessité d’une surveillance génomique, pour surveiller l’évolution du virus et ses implications sur la dynamique de transmission et les mesures de réponse comme les vaccins. Les informations de séquençage fournissent des informations cruciales pour la prise de décision lors d’épidémies et de pandémies. Les 8 et 9 juin 2022, le Bureau régional de l’OMS pour la Méditerranée orientale a organisé une réunion en Égypte avec des organisations partenaires et des pays pour discuter du cadre de surveillance intégrée des agents pathogènes respiratoires, y compris le rôle de la surveillance génomique. Le point focal régional du laboratoire a planté le décor :

« Actuellement, 19 des 22 pays de la Région de la Méditerranée orientale disposent de capacités de séquençage génomique. Un réseau régional a été établi pour permettre à tous les pays d’avoir accès au séquençage et de renforcer leurs capacités de manière cohérente et collaborative pour être en mesure de détecter, d’enquêter et de répondre au COVID-19 et à d’autres maladies infectieuses émergentes et réémergentes avec épidémie et pandémie. potentiel. »

– Dr Amal Barakat, Point focal régional des laboratoires, OMS

Quelques faits saillants des histoires partagées par les pays lors de la réunion :

Maroc

Suite à l’augmentation significative de la capacité de diagnostic moléculaire du SRAS-CoV-2 dans le pays permettant jusqu’à 250 000 tests par jour, le Centre national de la grippe du ministère de la Santé (MOH) a reconnu très tôt que le besoin de séquençage du SRAS-CoV-2 était également en augmentation. Pour y remédier, le Maroc a mis en place un consortium national de quatre laboratoires – deux publics et deux privés – pour couvrir différentes régions géographiques du pays.

« Le Consortium nous permet de répondre aux besoins de surveillance génomique en faisant appel aux capacités et capacités du secteur privé. Ce fut une réalisation majeure et représente une opportunité pour nous alors que nous réfléchissons à la prochaine génération de surveillance de la santé publique. »

– Professeur Hisham Ouzmil, Centre National de la Grippe, Maroc

Oman

Le Laboratoire central de santé publique du ministère de la Santé (CPHL) sert de laboratoire régional de référence de l’OMS pour le COVID-19. Le CPHL s’est associé à des partenaires universitaires nationaux et locaux pour renforcer les capacités de la main-d’œuvre, augmenter la couverture nationale de la surveillance génomique et développer des algorithmes de sélection des cas pour le séquençage afin que les tendances virologiques associées à différentes sous-populations telles que les voyageurs, les patients gravement malades et les cas de différentes régions géographiques régions pourraient être bien comprises.

« La génomique nous a aidés à mieux comprendre l’épidémiologie du COVID-19 à Oman. Relier les données génomiques aux données épidémiologiques et cliniques et analyser les tendances d’autres pays maximise l’utilité et la puissance de la génomique. Nous sommes heureux de travailler avec d’autres pays, de partager nos expériences et de renforcer nos collaborations au fur et à mesure que nous tirons des leçons pour la préparation future à une pandémie.

– Dr Hanan Alkindi, Laboratoire central de santé publique, Oman

Arabie Saoudite

Un effort massif a été entrepris pour étendre la surveillance génomique afin que la phylodynamique virale puisse être comprise dans toutes les régions géographiques du pays et pour examiner les tendances parmi les cas graves, les cas liés aux voyages, les cas post-vaccinaux et les réinfections.

« Plus de 60 000 échantillons de SARS-CoV-2 ont été séquencés dans tout le pays. Nous avons la possibilité d’utiliser la capacité établie pour diverses menaces pour la santé publique et nous sommes prêts pour les futures urgences.

– Dr Ahmed Albarraq, Autorité de santé publique, Arabie saoudite

Les résultats de la réunion et les réflexions des pays sur le rôle de la génomique pendant la pandémie de COVID-19 et les futures urgences permettront à la Région de planifier efficacement et d’attirer l’attention sur l’avenir de la surveillance intégrée des agents pathogènes respiratoires, y compris la surveillance génomique. Le cadre opérationnel régional pour la surveillance intégrée est en cours de finalisation et sera disponible plus tard cette année, y compris les possibilités de surveillance génomique dans le cadre du programme récemment lancé Stratégie mondiale de surveillance génomique des agents pathogènes à potentiel pandémique et épidémique 2022-2032.

La Stratégie mondiale sur 10 ans permettra aux pays de la Région de la Méditerranée orientale, ainsi qu’à d’autres Régions, de capitaliser sur les gains réalisés et de consolider le rôle de la génomique dans les futures pratiques de santé publique. Cliquez ici pour en savoir plus sur la Stratégie mondiale de surveillance génomique des agents pathogènes à potentiel pandémique et épidémique 2022-2032.