Voici ce que nous savons de C.1.2.—La nouvelle variante de Covid hautement muté d’Afrique du Sud


Ligne du dessus

Il y a eu beaucoup de buzz la semaine dernière sur une nouvelle variante de coronavirus identifiée en Afrique du Sud qui semble être plus fortement muté que toute autre variante signalée par l’Organisation mondiale de la santé (OMS) comme une variante d’intérêt ou de préoccupation, mais comprend toujours seulement une petite partie des cas de Covid-19 du pays et n’a pas fait l’objet d’une enquête concluante sur l’impact de ses mutations sur le comportement du virus.

Faits marquants

L’évolution de cette nouvelle variante, nommée C.1.2., a été détaillée dans un étude de préimpression publié plus tôt ce mois-ci par l’Institut national sud-africain des maladies transmissibles et la plate-forme d’innovation et de séquençage de la recherche KwaZulu-Natal.

Évolué à partir de C.1., l’une des lignées de coronavirus qui a dominé lors de la première vague d’infections en Afrique du Sud à la mi-mai de l’année dernière, C.1.2. a été identifié pour la première fois dans les provinces sud-africaines de Mpumalanga et Gauteng en mai 2021.

Il s’est depuis propagé à la plupart des provinces d’Afrique du Sud, ainsi qu’à une poignée d’autres pays d’Afrique, d’Europe, d’Asie et d’Océanie, selon l’étude, qui attend toujours un examen par les pairs.

Les auteurs de l’étude ont déclaré qu’ils étaient préoccupés par la variante en raison de la rapidité avec laquelle il a muté : il se situe entre 44 et 59 mutations du virus d’origine détecté à Wuhan, ce qui le rend plus muté que tout autre variante préoccupante identifiée par l’OMS de la variante de L’intérêt.

Il contient également de nombreuses mutations qui ont été associées à une transmissibilité accrue et à une capacité accrue à échapper aux anticorps dans d’autres variantes, ont déclaré les scientifiques, bien qu’elles se produisent dans différents mélanges et que leurs impacts sur le virus ne soient pas encore entièrement connus.

Richard Lessells, spécialiste des maladies infectieuses et l’un des auteurs de l’étude, Raconté Reuters que C.1.2. peut avoir plus de propriétés d’évasion immunitaire que la variante delta super-prévalente, sur la base de son schéma de mutations, mais la nouvelle variante est toujours en cours d’examen.

Contra

Au-delà de sa transmission et de sa réponse aux vaccins restant inconnus, Lessells a averti que les gens ne devraient pas être trop préoccupés par C.1.2. pourtant, comme on s’attendait à ce que des variantes avec plus de mutations émergent plus tard dans la pandémie. De plus, C.1.2. représente toujours une très petite partie, mais en constante augmentation, de tous les cas d’Afrique du Sud. Elle ne représentait que 1% des échantillons en juin et 3% en juillet, contre 67% des échantillons en juin et 89% en juillet pour la variante delta.

Citation cruciale

Tulio de Oliveira, directeur de la plate-forme d’innovation et de séquençage de la recherche KwaZulu-Natal, a déclaré que la variante n’avait été détectée que dans une centaine d’échantillons séquencés, « un nombre très faible », a-t-il souligné lors d’une conférence lundi. « C’est encore un très petit pourcentage, mais encore une fois, nous gardons vraiment un œil là-dessus. Il a toutes les signatures de l’évasion immunitaire.

Contexte de la clé

Les modifications du virus ont entraîné de nouvelles vagues d’infections pendant la pandémie. Par exemple, les États-Unis sont au milieu d’une augmentation massive des infections, des hospitalisations et des décès en raison de la variante delta plus infectieuse. La recherche suggère que cette variante présente plus du double du risque d’hospitalisation de la variante alpha du Royaume-Uni, et qu’elle a également eu des conséquences néfastes sur l’efficacité du vaccin en termes de prévention des infections, bien que les jabs préviennent encore largement les maladies graves. Le lambda, identifié pour la première fois au Pérou mais qui se propage maintenant à travers l’Afrique du Sud, est une autre variante préoccupante à la suite de recherches suggérer certaines de ses mutations peuvent résister à la neutralisation par les anticorps induits par le vaccin. Il n’est pas clair si Lambda est plus dangereux que la variante delta.

Tangente

L’Organisation mondiale de la santé a quatre variantes identifiées comme variantes préoccupantes et quatre variantes identifiées comme variantes d’intérêt (cette étiquette est donnée lorsqu’elles sont confirmées comme étant plus sévères ou transmissibles). C.1.2. ne se qualifie actuellement ni l’un ni l’autre. Cependant, une autre variante qui serait originaire d’Afrique du Sud a été qualifiée de variante préoccupante. Beta inquiétait les scientifiques et les responsables de la santé en raison de sa propagation rapide à travers l’Afrique du Sud et en raison de preuve certains vaccins étaient moins puissants contre la variante.

Lectures complémentaires

« La variante Delta fait plus que doubler le risque d’hospitalisation pour Covid, selon une étude britannique » (Forbes)

« Des scientifiques sud-africains affirment que la nouvelle variante pourrait avoir une « transmissibilité accrue » » (Bloomberg)

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