Une « chance aveugle » découvre le premier cas de variante Omicron en Irlande, selon Nphet


Le premier cas confirmé de la variante Omicron en Irlande a été identifié par « chance aveugle », selon les responsables de la santé publique.

L’affaire concernait une personne récemment revenue d’un pays d’Afrique australe, où la nouvelle variante a été identifiée pour la première fois. Sept pays désignés de la région font désormais l’objet de restrictions de voyage.

La personne était retournée en Irlande avant que les restrictions ne soient imposées et a ensuite développé des symptômes qui ont nécessité un test PCR au cours de la semaine dernière.

Décrivant le cas lors d’un point de presse mercredi, le Dr Cillian de Gascun, directeur du Laboratoire national de référence pour les virus, a déclaré qu’il n’avait aucun détail sur la gravité du cas.

Le Dr de Gascun a déclaré qu’il y avait « un élément de chance aveugle » impliqué dans l’identification du cas, car il était inclus dans un échantillon régulier de 10 pour cent de tous les cas qui est référé au laboratoire du NVRL à Backweston chaque semaine.

Il a déclaré qu’un examen des cas impliquant une défaillance du gène S, qui peut être utilisé pour identifier les cas potentiels d’Omicron, avait été effectué, remontant à début octobre.

Celui-ci a identifié 14 échantillons récents présentant cette caractéristique, dont huit ont pu être récupérés. Ceux-ci ont été envoyés pour le séquençage du génome entier, mais un seul a été confirmé comme impliquant Omicron. La recherche des contacts améliorée autour de l’affaire a depuis commencé.

Sept autres cas avec abandon du gène S, qui peuvent être indicatifs d’Omicron, n’impliquent pas cette variante mais une sous-lignée de la variante dominante Delta.

Selon le Dr de Gascun, la prévalence des cas d’abandon du gène S était bien inférieure à 1 %. La grande majorité des cas d’octobre et de novembre n’étaient plus disponibles pour le séquençage.

Cas confirmés à l’hôpital Cas confirmés en USI
536
110

Le Dr de Gascun a déclaré qu’il n’y avait aucune preuve de transmission communautaire de la variante en Irlande, et pour cette raison, des mesures de voyage avaient été introduites pour minimiser la propagation. Une fois qu’une variante pénètre dans un pays, elle doit atteindre une « masse critique », après quoi la dominance se produit sur quatre à huit semaines.

Environ 1 500 cas par semaine peuvent être génétiquement séquencés, soit environ 5% de tous les cas, a-t-il déclaré lors du briefing.

Le NVRL avait prévu que le test d’abandon du gène S aurait pu être utilisé comme test de substitution pour la présence d’Omicron, avant le séquençage, mais le Dr de Gascun a déclaré que le fait que seul un échantillon sur huit identifié de cette manière s’est avéré être la nouvelle variante a montré qu’elle ne pouvait pas être utilisée isolément comme mesure de surveillance.

Les fonctionnaires étudient maintenant quelle pourrait être la meilleure approche. Outre les cas liés aux voyages et les contacts étroits, ils essaieront de trouver le meilleur moyen d’échantillonnage qui puisse «caractériser ce qui se passe dans la population en général».

« Nous n’avons découvert ce manque d’association entre le ciblage du gène S et Omicron que ce matin. »

Réponse Omicron

L’émergence la semaine dernière de la nouvelle variante a incité vendredi le gouvernement à imposer des restrictions de voyage aux passagers en provenance de sept pays d’Afrique australe : Afrique du Sud, Botswana, Zimbabwe, Namibie, Lesotho, Eswatini et Mozambique.

Les personnes arrivant en Irlande en provenance de ces pays doivent se mettre en quarantaine chez elles pendant 10 jours après leur entrée dans l’État.

Bien que le nombre de voyageurs impactés soit faible, la réintroduction des restrictions de voyage marque un nouveau retour à des restrictions plus strictes pour maîtriser le Covid.

Les voyageurs de ces pays devront également présenter un résultat de test PCR pré-vol «non détecté», quel que soit leur statut vaccinal, se mettre en quarantaine à domicile pendant 10 jours et subir deux autres tests PCR.

L’obligation est antidatée pour les arrivées récentes en provenance de ces pays, qui seront localisées et contactées à l’aide du formulaire de localisation de passagers. La Garda surveillera la conformité, dans un premier temps.

Les inquiétudes concernant Omicron et le niveau élevé de cas de Covid dans l’État ont conduit le gouvernement à approuver une série de mesures.

Ces mesures exigent que les voyageurs entrant en Irlande en provenance de n’importe quel pays présentent des résultats négatifs aux tests PCR ou antigéniques, introduisent le port du masque pour les enfants du primaire à partir de la troisième classe et demandent aux parents de limiter la socialisation de leurs enfants.

Pouvoirs pandémiques

Deux textes législatifs – un pour étendre plusieurs pouvoirs de Covid et un spécifiquement pour réactiver la quarantaine obligatoire des hôtels si nécessaire – doivent être présentés au Dáil et au Seanad dans les prochains jours.

La législation hôtelière obligatoire est nécessaire car ces pouvoirs sont déjà arrivés à expiration, tandis que les autres pouvoirs Covid – y compris ceux concernant les masques, les restrictions d’accueil, les certificats Covid, les restrictions de voyage et autres – doivent expirer au début de l’année prochaine.

Les autorités préparent actuellement des ordonnances exigeant que les voyageurs entrant dans le pays présentent un test PCR ou antigénique négatif à partir de vendredi. Il y aura des « contrôles ponctuels » à l’aéroport pour s’assurer que les voyageurs sont conformes, mais les responsables ont déclaré qu’il appartiendrait principalement aux compagnies aériennes et aux compagnies de ferry de s’assurer que les passagers pourraient présenter un test négatif.

Le gouvernement envisage des amendes pour les transporteurs qui autorisent les personnes sans test à embarquer, tandis qu’un porte-parole a confirmé qu’il y aurait des amendes pour les passagers qui ne pourraient pas présenter un test négatif. Il n’y aura pas de chèques pour les voyageurs en provenance d’Irlande du Nord.

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