Un voyage fantastique en génomique


Dans l’introduction du numéro spécial « A Fantastic Voyage in Genomics » (1), Laura M. Zahn a décrit la prévention et le traitement des maladies sur la base du génome. Juste avant la publication, j’ai écouté une présentation sur la médecine de précision avec la génomique et j’ai acquis des connaissances sur (a) la base de données génomique finlandaise et (b) la distribution de la race basée sur la génomique.
Concernant (a), les instituts finlandais ont préparé divers registres de santé et de protection sociale depuis les années 1950 (2). Les stocks à long terme de dossiers sont disponibles pour indiquer les potentiels de maladie par génome et âge, et les réalisations de la marche entre les gènes et les maladies concernant le finnois sont publiques (3, 4). Au Japon, la DDBJ (Banque de données ADN du Japon) a démarré en 1987, et elle fournit un service de super-ordinateur pour les analyses génétiques depuis 2012 (5). Bien que le gouvernement japonais ait encouragé l’introduction des dossiers médicaux électroniques depuis environ 2001, la résistance du personnel et les préoccupations des patients concernant la violation de la vie privée ont rendu difficile l’intégration des bases de données sur les maladies dans le pays.
Concernant (b), j’ai été surpris de la grande distance entre les Finlandais et les Hongrois sur la carte génétique européenne (6) car la langue finnoise et la langue hongroise sont proches dans la famille linguistique. Une étude selon laquelle la génétique a une corrélation plus élevée avec la géographie qu’avec le langage (7) m’en donne la preuve. De cette lacune, j’attends grandement un potentiel de la génomique pour révéler la dynamique de la culture et des peuples anciens.

Les références:
1. LM Zahn, Un voyage fantastique en génomique. Sciences (80-. ). 358, 56-57 (2017).
2. J. Haukka, Registres finlandais de la santé et de la protection sociale dans la recherche épidémiologique. Ni. Epidémiol. 14 (2009), doi:10.5324/nje.v14i1.284.
3. Le projet GEN2PHEN, FinDis (Base de données finlandaise sur les maladies) (2013), (disponible sur http://www.findis.org).
4. Initiative de séquençage Suomi, SISu (2016), (disponible sur http://www.sisuproject.fi).
5. NIG (Institut national de génétique), DDBJ (DNA Data Bank of Japan) (2017), (disponible sur http://www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html).
6. M. Nelis et al., Structure génétique des Européens : une vue du nord-est. PLoS One. 4, e5472 (2009).
7. RR Sokal, Distances génétiques, géographiques et linguistiques en Europe. Proc. Natl. Acad. Sci. États-Unis 85, 1722–6 (1988).

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