Quelles sont les nouvelles variantes de Covid ? Ce que la montée en puissance des sous-variantes Omicron BA.4 et BA.5 en Afrique du Sud signifie pour le Royaume-Uni


Le nombre d’infections quotidiennes en Afrique du Sud a été multiplié par près de sept en moins d’un mois, passant de 557 le 11 avril à 3 839 le 1er mai.

L’augmentation a été tirée par deux nouvelles sous-variantes, BA.4 et BA.5, qui sont passées de moins de 1% des cas dans le pays à plus de 50% en quelques semaines. Au 29 avril, ils étaient les souches les plus dominantes en Afrique du Sud.

Pour l’instant, cependant, seule une poignée d’infections BA.4 et BA.5 ont été identifiées au Royaume-Uni, mais la vitesse à laquelle elles ont décollé en Afrique du Sud et la vitesse à laquelle les souches originales d’Omicron ont dépassé Delta montrent qu’elles doivent être surveillés attentivement.

Alors que la proportion de cas représentés par les nouvelles sous-variantes en Afrique du Sud est élevée et en augmentation, la vague est encore en deçà du précédent pic du pays de 29 975 le 15 décembre.

Néanmoins, la hausse semble devoir se poursuivre et fait craindre que le pays n’entre dans une cinquième vague de Covid.

BA.4 et BA.5 sont clairement une source de préoccupation – pas seulement en Afrique du Sud mais dans le monde entier.

Ce que nous savons sur BA.4 et BA.5 jusqu’à présent

La mesure dans laquelle cette vague se développe en Afrique du Sud reste incertaine en raison d’un récent arriéré de rapports causé par un jour férié lundi cette semaine.

L’Afrique du Sud a assoupli les restrictions, ainsi que le passage à l’hiver, connaissant des températures plus froides qui aident le virus à prospérer et forcent les gens à l’intérieur plus souvent.

On ne sait donc toujours pas quelle part de l’augmentation des cas est due aux nouvelles sous-lignées et quelle part est due à d’autres facteurs, liés au comportement et à la météo.

La proportion croissante de nouvelles infections représentées par BA.4 et BA.5 provient, en partie, de mutations dans la protéine de pointe, ce qui signifie que le virus pourrait être capable d’esquiver l’immunité du corps dans une certaine mesure, aidé par la diminution de l’immunité des vagues précédentes. .

Ces mutations de protéines de pointe semblent donner à BA.4 et BA.5 un avantage de croissance par rapport aux autres sous-variants d’Omicron tels que BA.2, qui est maintenant la souche dominante au Royaume-Uni.

Mais jusqu’à présent, rien n’indique que BA.4 et BA.5 provoquent une aggravation significative des infections, selon les experts.

Ceci est conforme à la théorie selon laquelle BA.4 et BA.5 ne sont plus virulents, car ils semblent se comporter à peu près comme la lignée BA.2 globalement dominante.

En outre, BA.4 et BA.5 sont également beaucoup plus étroitement liés à BA.2 qu’à BA.1 – ce qui suggère qu’ils pourraient causer plus de problèmes dans les régions où les infections antérieures ont été dominées par BA.1 plutôt que BA.2 parce que ils seront moins immunisés contre les nouvelles sous-variantes. Au Royaume-Uni, c’était BA.2 qui dominait.

« BA.4 et BA.5 peuvent avoir un léger avantage sur les autres lignées Omicron car ils semblent mieux infecter les personnes qui ont déjà eu une infection Omicron BA.1, en particulier si elles n’ont pas été vaccinées », a déclaré le professeur François Balloux, directeur. de l’Institut de génétique de l’University College de Londres.

BA.4 et BA.5 sont très similaires et partagent la même séquence de protéine de pointe.

En tant que tels, il n’y a aucune raison de s’attendre à ce qu’ils se comportent différemment et ils peuvent être «regroupés» en toute sécurité, selon les experts.

Les nouvelles sous-variantes ont-elles des symptômes différents ?

Il existe actuellement un nombre relativement faible de cas BA.4 et BA.5, malgré leur croissance rapide en Afrique du Sud, et il est donc trop tôt pour savoir avec certitude s’il existe de nouveaux symptômes associés à ces lignées.

Cependant, étant donné que les lignées sont toujours classées comme Omicron et que la majorité des mutations (en particulier au sein de la protéine de pointe) sont les mêmes, il est probable que les symptômes seront similaires, selon l’Institut national des maladies transmissibles d’Afrique du Sud à Johannesburg.

Que signifie la croissance de BA.4 et BA.5 pour les numéros Covid britanniques ?

Les souches Omicron BA.4 et BA.5 restent jusqu’à présent relativement rares en dehors de l’Afrique du Sud.

Il y a eu 31 BA.4 et 30 BA.5 signalés au Royaume-Uni, selon la base de données GISAID, considérée comme la source la plus à jour.

Cela représente une augmentation par rapport aux six cas de BA.4 qui avaient été enregistrés par le gouvernement le 17 avril et aux trois de BA.5 au 16 avril.

Selon le professeur Balloux, de l’UCL : « Il n’y a pas suffisamment de données à ce stade pour prédire avec certitude si BA.4 ou BA.5 remplacera BA.2 à l’échelle mondiale. »

Ce qu’il peut dire, cependant, c’est qu’il semble moins susceptible de devenir dominant au Royaume-Uni et en Europe qu’en Afrique du Sud et aux États-Unis.

L’étendue de sa propagation au Royaume-Uni dépend en grande partie du fait que BA.4 et BA.5 réussissent aussi bien à réinfecter les personnes qui ont déjà eu une infection Omicron BA.2 – qui est dominante au Royaume-Uni – qu’ils semblent l’avoir été pour ceux qui avait une infection BA.1 antérieure, qui était la souche dominante en Afrique du Sud.

Et il est tout simplement trop tôt pour le dire.

« Si une infection antérieure par BA.2 offrait une meilleure protection immunitaire contre BA.4/BA.5 que BA.1, nous pourrions anticiper que les régions du monde qui ont connu de grandes vagues de BA.1, comme l’Afrique du Sud et les États-Unis, pourraient être plus à risque d’une grande vague BA.4/BA.5 que ceux où BA.2 a causé la majeure partie des infections à Omicron comme cela s’est produit au Royaume-Uni, en Europe et en Asie », a déclaré le professeur Balloux.

Au Royaume-Uni, les taux de cas de BA.2, qui ont culminé en mars, ont chuté de plus de 60% depuis leur pic du 31 mars et les admissions à l’hôpital commencent également à chuter fortement.

Mais l’Agence britannique de sécurité sanitaire (UKHSA) surveille de près BA.4 et BA.5.

Bien que l’analyse actuelle suggère qu’ils ne sont pas plus graves que BA.2 ni la souche originale d’Omicron, les mutations des sous-variantes suggèrent qu’ils pourraient échapper plus facilement aux vaccins – bien qu’il reste à voir combien plus facilement.

Dans le même temps, des études montrent que l’efficacité du vaccin diminue de manière significative trois mois après le premier rappel.

À l’heure actuelle, les niveaux d’infection au Royaume-Uni sont aidés par le fait que 90% de sa population possède une certaine immunité contre une infection antérieure.

« À l’heure actuelle, au Royaume-Uni, plus de 90% des personnes ont probablement déjà eu le covid et la plupart des autres sont vaccinées, de sorte que plus de 99% des personnes de plus de 50 ans ont des anticorps du vaccin ou de l’infection et la plupart des deux », a déclaré Professeur Paul Hunter, de l’Université d’East Anglia.

Mais à l’automne, lorsque le temps se refroidit, que l’immunité diminue et que les écoles reprennent après les vacances d’été, à quel point BA.4 et BA.5 représentent-ils une menace ?

Ce que prévoient les experts :

Tim Spector, le professeur du King’s College de Londres qui gère l’application d’étude ZOE Covid, a déclaré: «Je ne suis pas inquiet pour le moment, mais c’est quelque chose à surveiller de près…. Le dernier rapport suggère qu’il y a très peu de cas BA.4 et BA.5 au Royaume-Uni.

François Balloux, de l’UCL, a déclaré : « Je ne voudrais pas faire de prédiction à ce stade sur ce que sera la prochaine « variante », au Royaume-Uni ou ailleurs. Bien que nous puissions supposer que BA.4/5 est susceptible de faire mieux à ce stade dans les endroits où l’onde Omicron a été principalement causée par BA.1 [such as South Africa and the US but not the UK and Europe]”.

Le professeur Lawrence Young, virologue à l’Université de Warwick, a déclaré: «Nous devons garder un œil sur les variantes BA.4 et BA.5 qui alimentent une nouvelle vague d’infections en Afrique du Sud.

« L’immunité à travers le monde entraînera le développement de nouvelles variantes qui sont plus efficaces pour esquiver la réponse immunitaire générée par l’infection par des variantes précédentes et par la vaccination avec les vaccins actuels conçus contre la souche originale du virus de Wuhan.

« Il n’y a actuellement aucune preuve que l’infection par BA.4 ou BA.5 entraîne une maladie plus grave. »

Les experts du gouvernement britannique estiment qu’avec plus de 68% des personnes ayant reçu leur dose de rappel dans ce pays et des millions susceptibles d’avoir été infectées par une forme de la variante Omicron, l’immunité de la population résistera bien contre BA.4 et BA. 5 et les futures ramifications d’Omicron et n’entraînent pas autant d’admissions à l’hôpital que les premières vagues d’Omicron et de BA.2.

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