Omicron, une nouvelle variante de Covid-19 avec un nombre élevé de mutations, déclenche des interdictions de voyager et inquiète les scientifiques

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Il semble se propager rapidement dans certaines régions d’Afrique du Sud et les scientifiques craignent que son nombre inhabituellement élevé de mutations ne le rende plus transmissible et entraîne une évasion immunitaire.

Le groupe consultatif technique de l’OMS sur l’évolution du virus du SRAS-CoV-2 (TAG-VE), un groupe indépendant d’experts, s’est réuni vendredi pour discuter de la variante, selon un communiqué de l’OMS.

Les conseillers ont recommandé que l’OMS désigne le variant comme « préoccupant », en faisant référence au grand nombre de mutations du variant, à la possibilité d’un risque accru de réinfection et à d’autres preuves.

Un certain nombre d’études sont en cours et l’OMS informera les États membres et le public selon les besoins, selon le communiqué de l’OMS.

L’OMS a appelé les pays à renforcer leurs efforts de surveillance et de séquençage pour mieux comprendre les variantes du coronavirus.

« Au départ, cela ressemblait à des épidémies de grappes, mais à partir d’hier, l’indication est venue de nos scientifiques du Réseau de surveillance génomique qu’ils observaient une nouvelle variante », a déclaré jeudi Joe Phaahla, ministre sud-africain de la Santé, soulignant qu’il est on ne sait pas encore où la variante est apparue pour la première fois.

Les responsables sud-africains ont initialement déclaré qu’il y avait un cas confirmé chez un voyageur d’Afrique du Sud à Hong Kong. Ensuite, les autorités sanitaires de Hong Kong ont identifié vendredi un deuxième cas de la variante B.1.1.529 parmi les voyageurs de retour au même étage d’un hôtel de quarantaine désigné.

Vendredi également, le gouvernement belge a déclaré qu’une personne récemment arrivée de l’étranger et non vaccinée avait été testée positive pour la nouvelle variante, marquant le premier cas en Europe.

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Tulio de Oliveira, directeur du Center for Epidemic Response and Innovation d’Afrique du Sud, a déclaré que la variante a « beaucoup plus de mutations que prévu », ajoutant qu’elle « se propage très rapidement et nous nous attendons à voir des pressions dans le système de santé dans le prochain quelques jours et semaines. »

Les virus, dont celui qui cause le Covid-19, mutent régulièrement et la plupart des nouvelles mutations n’ont pas d’impact significatif sur le comportement du virus et la maladie qu’ils provoquent.

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Ce que nous savons de la nouvelle variante

Lawrence Young, virologue et professeur d’oncologie moléculaire à la Warwick Medical School au Royaume-Uni, a déclaré que la variante était « très inquiétante ».

« C’est la version du virus la plus fortement mutée que nous ayons vue à ce jour. Cette variante porte certains changements que nous avons vus auparavant dans d’autres variantes, mais jamais tous ensemble dans un virus. Il présente également de nouvelles mutations », a déclaré Young dans un communiqué. .

La variante a un nombre élevé de mutations, environ 50 au total. Surtout, les scientifiques génomiques sud-africains ont déclaré jeudi que plus de 30 des mutations avaient été trouvées dans le protéine de pointe — la structure que le virus utilise pour pénétrer dans les cellules qu’ils attaquent.

Neil Ferguson, directeur du MRC Center for Global Infectious Disease Analysis à l’Imperial College de Londres, a déclaré dans un communiqué que le nombre de mutations sur la protéine de pointe était « sans précédent ».

« Le gène de la protéine de pointe [is] la protéine qui est la cible de la plupart des vaccins. On craint donc que cette variante ait un plus grand potentiel d’échapper à l’immunité antérieure que les variantes précédentes », a déclaré Ferguson.

Sharon Peacock, professeur de santé publique et de microbiologie à l’Université de Cambridge, a déclaré que si le nombre total de cas de Covid-19 est relativement faible en Afrique du Sud, il y a eu une augmentation rapide au cours des sept derniers jours.

Elle a déclaré que si 273 nouvelles infections avaient été enregistrées le 16 novembre, le chiffre était passé à plus de 1 200 cas au 25 novembre, dont plus de 80% provenaient de la province du Gauteng.

« Le tableau épidémiologique suggère que cette variante peut être plus transmissible, et plusieurs mutations sont compatibles avec une transmissibilité accrue », a déclaré Peacock dans un commentaire partagé par le Science Media Centre du Royaume-Uni.

Elle a ajouté que bien que la signification des mutations et de leur combinaison soit inconnue, certaines de celles présentes dans la dernière variante ont été associées dans d’autres à l’évasion immunitaire.

Ce que nous ne savons pas

Peacock, de Oliveira, Ferguson et d’autres scientifiques ont déclaré qu’il était trop tôt pour déterminer le plein impact des mutations sur l’efficacité du vaccin.

De Oliveira a souligné que les injections de Covid-19 sont toujours le meilleur outil contre le virus, ajoutant que des études en laboratoire doivent encore être menées pour tester l’évasion des vaccins et des anticorps.

D’autres études doivent également être menées pour comprendre la gravité clinique de la variante par rapport aux variantes précédentes.

On ne sait pas non plus d’où la nouvelle mutation a émergé. Bien qu’il ait été identifié pour la première fois en Afrique du Sud, il peut provenir d’ailleurs.

« Il est important de ne pas supposer que la variante est apparue pour la première fois en Afrique du Sud », a déclaré Peacock.

Réaction rapide

Les scientifiques ont félicité les autorités sanitaires sud-africaines pour leur réaction rapide à une épidémie de Covid-19 dans la province du Gauteng du pays, qui a conduit à la découverte de la nouvelle variante.

Lorsque les cas dans la province ont commencé à augmenter à un taux plus élevé qu’ailleurs, les experts de la santé se sont concentrés sur le séquençage des échantillons de ceux qui ont été testés positifs, ce qui leur a permis d’identifier rapidement la variante B.1.1.529.

Peacock a déclaré que le ministère sud-africain de la Santé et ses scientifiques « doivent être applaudis pour leur réponse, leur science et pour sonner l’alarme au monde ».

Elle a ajouté que le développement montre à quel point il est important d’avoir d’excellentes capacités de séquençage et de partager son expertise avec les autres.

La réaction à l’annonce de la nouvelle variante découverte par les autorités sanitaires sud-africaines a également été rapide. Un certain nombre de pays ont imposé de nouvelles interdictions de voyager et les marchés aux États-Unis, en Asie et en Europe ont plongé à la suite de la nouvelle.
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Des responsables britanniques ont annoncé jeudi que six pays africains seraient ajoutés à la « liste rouge » des voyages de l’Angleterre après que l’Agence britannique de sécurité sanitaire ait signalé ses inquiétudes concernant la variante.

Le ministre britannique de la Santé, Sajid Javid, a déclaré que les vols vers le Royaume-Uni en provenance d’Afrique du Sud, de Namibie, du Lesotho, du Botswana, d’Eswatini et du Zimbabwe seront suspendus à partir de vendredi midi et que les six pays seront ajoutés à la liste rouge, c’est-à-dire les résidents britanniques et les ressortissants britanniques et irlandais. arrivant à la maison depuis ces points de départ doivent subir une quarantaine d’hôtel de 10 jours à leurs propres frais.

S’exprimant vendredi, Javid a déclaré qu’il était « très probable » que la variante B.1.1.529 se soit propagée au-delà de l’Afrique australe. Dans une déclaration à la Chambre des communes du Royaume-Uni vendredi, Javid s’est dit préoccupé par le fait que cela pourrait « représenter un risque substantiel pour la santé publique ».

Singapour, le Japon, la Malaisie, les Philippines, Israël, la Jordanie, l’Italie, l’Autriche, la France, les Pays-Bas et l’Allemagne ont également annoncé de nouvelles restrictions pour les voyageurs en provenance de la région, et la Commission européenne a proposé d’interdire les vols d’Afrique du Sud vers le bloc.

La compagnie aérienne Emirates a annoncé vendredi qu’elle restreindrait les vols de la région vers Dubaï, citant le Centre de commandement et de contrôle (CCC) Covid-19 de Dubaï.

Le Dr Anthony Fauci, directeur de l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses, a déclaré vendredi à CNN que les États-Unis prendraient une décision le plus rapidement possible sur le blocage des voyages en provenance de certains pays africains à la lumière de la nouvelle variante.

L’Afrique du Sud, comme une grande partie de la région, a souffert de trois vagues importantes de Covid-19 depuis le début de la pandémie. Alors que le nombre de nouvelles infections à travers le pays est encore relativement faible et que les niveaux de positivité sont inférieurs à 5%, les responsables de la santé publique ont déjà prédit une quatrième vague en raison d’une lenteur de la vaccination.

Jacqueline Howard, Duarte Mendonca, Niamh Kennedy et Mia Alberti de CNN à Londres, Andrew Carey et Amir Tal à Jérusalem, Antonia Mortensen à Milan, Tim Lister à Cordoue et Nadine Schmidt à Berlin ont contribué au reportage.

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