Les nouvelles variantes de Covid au Royaume-Uni et en Afrique du Sud peuvent se propager plus facilement, alors qu’est-ce que cela signifie pour la lutte contre le coronavirus ? | Coronavirus
https://www.theguardian.com/news/datablog/2021/jan/25/new-coronavirus-variants-may-spread-more-easily-so-what-does-this-mean-for-the-fight-against-covid
De nouvelles recherches suggèrent que les nouvelles variantes de coronavirus peuvent se propager plus facilement que le coronavirus ordinaire ou de type sauvage.
Cinquante-cinq pays ont désormais signalé la présence de la variante du coronavirus B.1.1.7, initialement identifiée au Royaume-Uni, et 23 pays ont identifié la variante 501Y.V2, initialement identifiée en Afrique du Sud.
Il est important de noter que la plupart des recherches caractérisant les nouvelles variantes ont été publiées en tant que « preprints », ce qui signifie que les études ne sont pas encore passées par le processus habituel d’examen par les pairs et de publication dans des revues.
Mutations dans les variantes modifier la structure des protéines « spike », qui est le mécanisme par lequel le coronavirus se fixe aux cellules.
Deux études distinctes ont examiné la « transmissibilité » de la variante B.1.1.7, c’est-à-dire sa facilité de propagation. Un papier de chercheurs du Center for Mathematical Modeling of Infectious Diseases (CMMID) au Royaume-Uni, ont utilisé la modélisation pour explorer différentes explications de l’augmentation de la prévalence de la variante B.1.1.7. Ils ont trouvé « des preuves solides d’une transmissibilité relative plus élevée estimée à 56% plus élevée que les variantes préexistantes ».
Ils reconnaissent également qu’il existe d’autres mécanismes qui pourraient produire des résultats similaires, tels qu’une augmentation de la durée pendant laquelle le virus est infectieux.
Une autre étude, avec des chercheurs collaborant de plusieurs institutions, a estimé la transmissibilité de B.1.1.7 au Royaume-Uni à environ 47% plus élevée que les autres types de coronavirus.
Qu’est-ce que cela signifie?
L’une des caractéristiques les plus importantes des virus et autres agents pathogènes est leur degré de contagiosité ou de transmission. Une mesure clé est la R0, ou numéro de reproduction de base, qui indique le nombre de nouveaux cas générés par une personne infectée.
Ainsi, pour un R0 de trois, nous nous attendrions à ce que chaque nouveau cas de maladie produise trois autres infections. Ce n’est pas seulement une mesure de l’infectiosité inhérente d’une maladie. Elle dépend également d’autres facteurs, dont le taux de contact au sein d’une population et la durée de la période infectieuse. C’est une valeur dépendante de la situation, donc dans une ville le R0 peut être plus élevé et dans une autre plus bas. Il suppose également que l’ensemble de la population est sensible à la maladie.
Plus tôt dans la pandémie, avec moins d’interventions comme la distanciation sociale et les masques, la moyenne des diverses estimations de R0 pour le coronavirus était d’environ 2,6. Compte tenu d’une augmentation de 50 % de la transmissibilité, le R0 pour un variant plus infectieux dans la même situation pourrait être d’environ 3,9 :
Mais le R0 n’est pas le seul chiffre important. Le nombre effectif de reproduction, R, est une valeur qui prend en compte la sensibilité de la population. Avec toute valeur R supérieure à 1, l’infection augmentera et se propagera dans la population.
Mais si certaines personnes ne sont pas sensibles à l’infection – en raison de l’immunité par la vaccination, parce qu’elles ont déjà été infectées ou pour d’autres raisons biologiques – ou si la transmission est freinée en raison de l’isolement d’une partie de la population, ou par l’utilisation de masques, alors la valeur R effective diminue.
Si le R effectif est réduit en dessous de un, la propagation peut être stoppée.
Ainsi, par exemple, l’un des articles publiés le B.1.1.7 ont constaté que le R efficace pour le coronavirus de type sauvage était d’environ 0,85 pendant les blocages dans diverses parties du Royaume-Uni. Cela signifie qu’avec ces interventions, les nouveaux cas diminuaient. Ici, vous pouvez voir comment un R effectif de 0,85 entraîne une tendance à zéro :
Cependant, dans le même temps, la variante B.1.1.7 avait un R effectif d’environ 1,25. Dans le même graphique, vous pouvez voir comment un R effectif de 1,25 entraîne une augmentation des cas, bien que les conditions de verrouillage soient toujours efficaces contre le type sauvage.
Cependant, lorsque le verrouillage et d’autres interventions sont renforcés, le R effectif peut être réduit en dessous de 1 même pour la variante la plus infectieuse, réduisant ainsi le nombre de nouveaux cas.
Tout cela signifie que dans les zones où davantage de variantes infectieuses sont établies dans la communauté, les contrôles actuels sont susceptibles d’être moins efficaces et doivent être renforcés pour prévenir le risque d’augmentation des cas, des décès et des maladies à long terme.
Dans des pays comme l’Australie, le Vietnam ou la Nouvelle-Zélande, où des variantes potentiellement plus infectieuses n’ont été trouvées que chez les voyageurs en quarantaine, les contrôles existants peuvent être suffisants à moins qu’ils ne soient transmis à la communauté, selon Hassan Vally, professeur agrégé en épidémiologie à l’Université La Trobe. , Australie.
« Nous ne voulons tout simplement pas que ce virus s’établisse, car s’il s’établit, il peut se propager plus rapidement dans toute la population et être plus difficile à contrôler », a-t-il déclaré.
« Mais si vous venez d’une base faible, vous devriez pouvoir y faire face en utilisant à peu près les mêmes stratégies que nous utilisons actuellement. »
Cependant, dans des pays comme le Royaume-Uni et les États-Unis, la situation est plus préoccupante.
« Le passage d’un virus circulant à une valeur R plus élevée, en raison de l’effet multiplicatif et de la croissance exponentielle, vous verrez la menace pour la population être beaucoup plus grande », a déclaré Vally.
Stuart Turville, professeur agrégé en virologie et immunologie à l’Institut Kirby, a déclaré que les résultats des études de préimpression devraient être vérifiés par des travaux supplémentaires, mais toute augmentation de la transmissibilité d’une variante de coronavirus « relèverait la barre » pour les contrôles.
« Si cette chose devient plus en forme, vous élevez la barre des anticorps, vous élevez la barre de la quarantaine, vous élevez la barre des blocages, cela devient une cible plus difficile », a-t-il déclaré.
Turville a déclaré que la question la plus importante avec les variantes de coronavirus émergentes est l’effet que toute mutation aura sur la réponse vaccinale.
Les premières recherches, à nouveau publiées sous forme d’études de préimpression, suggèrent que les vaccins sont efficaces contre la variante B.1.1.7, mais il peut y avoir des complications de la variante 501Y.V2.
