Indonésie : la pandémie qui fait rage offre un terrain fertile pour de nouvelles variantes | Pandémie de coronavirus Actualités

La vitesse et l’ampleur de l’épidémie de coronavirus en Indonésie ont créé un terrain fertile pour une nouvelle super-souche potentielle qui pourrait être encore plus contagieuse et mortelle que la variante Delta, mettent en garde les experts en maladies infectieuses du monde entier.

La semaine dernière, l’Indonésie a dépassé l’Inde et le Brésil pour devenir le pays signalant le plus grand nombre de cas quotidiens au monde. Jeudi, l’archipel a signalé plus de 49 500 nouveaux cas et 1 449 décès.

« De nouvelles variantes apparaissent toujours dans des régions ou des pays qui ne peuvent pas contrôler les épidémies », a déclaré Dicky Budiman, un épidémiologiste indonésien recherchant des variantes de coronavirus à l’Université Griffith d’Australie. « L’Organisation mondiale de la santé [WHO] dit que si plus de 5% des tests sont positifs, l’épidémie est incontrôlable. En Indonésie, il était supérieur à 10% depuis 16 mois au début de la pandémie. Maintenant, il est supérieur à 30 pour cent. Vous pouvez donc imaginer à quel point l’Indonésie a la possibilité de créer une nouvelle variante ou une super variante de COVID-19. »

Amin Soebandrio, directeur de l’Institut Eijkman, une organisation gouvernementale qui étudie les maladies infectieuses tropicales et émergentes, affirme qu’aucune nouvelle variante n’a encore fait surface en Indonésie, la vigilance est cruciale.

« Avec le nombre croissant de cas, nous ne pouvons pas nier que c’est possible et devons observer attentivement pour identifier de nouvelles variantes dès qu’elles apparaissent », a-t-il déclaré.

L’Indonésie a signalé jeudi un nombre record de décès dus au COVID-19. Avec ses hôpitaux incapables de faire face à la flambée des cas, de plus en plus de personnes doivent s’isoler à la maison [File: Adi Weda/EPA]

Variantes préoccupantes

Les virus changent constamment à travers des mutations de leurs gènes, créant des variantes plus avancées.

Le Dr Stuart Ray, vice-président de la médecine pour l’intégrité et l’analyse des données à la faculté de médecine de l’Université Johns Hopkins, déclare que de nouvelles variantes de COVID-19 sont détectées dans le monde chaque semaine, mais « c’est dans la nature des virus à ARN tels que le coronavirus d’évoluer et de changer – progressivement ».

Il dit « la plupart vont et viennent – ​​certains persistent mais ne deviennent pas plus fréquents ; une certaine augmentation de la population pendant un certain temps, puis s’estompe.

Ce n’est que lorsqu’une variante présente une augmentation de sa capacité de transmission, une gravité accrue en fonction des admissions à l’hôpital ou des décès, ou une efficacité réduite des traitements et des vaccins, que l’OMS classe la souche comme ‘variante préoccupante‘.

Globalement, il existe quatre variantes préoccupantes : la variante dite Alpha, identifiée pour la première fois au Royaume-Uni ; la variante Beta, identifiée pour la première fois en Afrique du Sud, la variante Delta, identifiée pour la première fois en Inde ; et la variante Gamma, identifiée pour la première fois au Brésil.

Soebandrio dit que tous sauf la variante Gamma ont été détectés en Indonésie, et que le pays a désormais la capacité de diagnostic pour détecter de nouvelles souches dans des délais courts. Plus de 3 000 chaînes de génomes ont été séquencées depuis le début de l’année en Indonésie contre seulement 200 à 300 l’an dernier. Les résultats montrent que la variante Alpha se propage toujours mais que Delta est dominant.

La variante Delta est « quatre à cinq fois plus contagieuse que le virus d’origine », a déclaré Shahid Jameel, le meilleur virologue indien qui dirigeait jusqu’à récemment le groupe consultatif du consortium indien de génomique SARS-CoV-2, qui surveille les variantes de COVID-19.

Jameel dit que la situation en Indonésie est maintenant « très similaire » à la deuxième vague de l’Inde en raison de « faibles taux » de vaccination. Selon le ministère de la Santé, seuls 8 % des Indonésiens sont complètement vaccinés.

Un officier de l’armée indonésienne vérifie les papiers d’un conducteur à un poste de contrôle à Jakarta. L’Indonésie a imposé des restrictions et des interdictions de voyager dans le but de limiter les déplacements et de contrôler une augmentation des cas de coronavirus [Bagus Indahono/EPA]

Possibilité de se déchaîner

Des représentants de deux des principaux groupes de recherche sur les coronavirus au monde aux États-Unis craignent que les conditions en Indonésie ne soient mûres pour l’émergence d’une nouvelle variante de COVID-19 préoccupante.

« Plus il y a d’infections dans une communauté, plus il y a de chances pour une nouvelle variante », a déclaré Ali Mokdad, professeur de sciences de la métrique de la santé à l’Institute for Health Metrics and Evaluation de Seattle. Il s’est également dit préoccupé par le festival indonésien de l’Aïd al-Adha, qui a eu lieu cette semaine et « l’activité autour de celui-ci ».

Le groupe de travail indonésien COVID-19 a publié une directive spéciale pour la semaine des vacances, interdisant les voyages publics dans tout le pays. Il a également prolongé un verrouillage partiel d’urgence, introduit le 3 juillet, jusqu’à lundi prochain.

Des milliers de membres du personnel de sécurité ont été déployés dans tout le pays pour faire respecter l’interdiction de voyager, après qu’un ordre similaire à l’Aïd al-Fitr, la fin du mois de jeûne du Ramadan, n’ait pas fait grand-chose pour empêcher les gens de voyager.

Mais le week-end dernier, la police et l’armée du port de Gilimanuk, dans l’ouest de Bali, ont regardé des milliers de travailleurs migrants embarquer sur des ferries surpeuplés pour retourner dans leurs familles à Java, l’épicentre de l’épidémie en Indonésie, pour célébrer les vacances. I Nengah Tamba, le chef de la régence dans laquelle se trouve Gilimanuk, refuse de faire appliquer la prolongation du confinement partiel d’urgence.

Le Dr Robert Bollinger, professeur de maladies infectieuses à la faculté de médecine de l’Université Johns Hopkins, prévient que COVID-19 « a le potentiel de muter en une nouvelle variante chaque fois qu’il infecte une nouvelle personne. Ainsi, le risque de nouvelles variantes est le plus élevé dans les communautés et les pays comptant le plus grand nombre de nouveaux cas, dont l’Indonésie. »

Mais prédire où et quand une nouvelle variante de préoccupation émergera, est actuellement au-delà de la capacité des scientifiques d’aujourd’hui.

« Tout ce que je peux dire, c’est que lorsque vous donnez à un virus à ARN comme celui-ci la possibilité de se déchaîner, il accumulera des mutations aléatoires plus fréquemment et les chances d’une nouvelle variante augmenteront », a déclaré le virologue indien Shahid Jameel.

« Ils devraient tirer des leçons de l’expérience de l’Inde, la principale étant une augmentation très rapide de la capacité hospitalière et de la disponibilité en oxygène. Car malheureusement, le pire est à venir pour la région.

Un hindou balinais participe au rituel du Ngrastiti Bhakti pour prier pour la fin de la pandémie le 14 juillet. [File: Fikri Yusuf/Antara Foto via Reuters]